Le Glossaire sur l'eau, le milieu marin et la biodiversité contient plus de 2065 termes associés à des définitions. Chaque terme peut présenter une ou plusieurs définitions associées à un sens de lecture particulier (commun, technique et réglementaire).
Le glossaire est multilingue avec des définitions en 3 langues (français, anglais et espagnol).
Il est structuré autour de 17 thématiques ; Milieu et Habitat, Espèce, Qualité de la ressource, Quantité de la ressource, Hydromorphologie, Climat, Santé, Opinion et société, Économie de l'environnement, Donnée et système d'information, Recherche développement et innovation (RDI), Gestion de l'eau et des milieux, Politique, Risque, Pression, Eau potable et assainissement, Usage.

Le glossaire est collaboratif : tout internaute peut soumettre une demande de modification ou d'ajout.
Pour garantir la fiabilité des informations diffusées, chaque définition est relue et potentiellement complétée par un groupe de relecteurs composé de thématiciens issus d'organismes reconnus dans le domaine de l'eau et de l'environnement. Les processus et modalités de production des contenus sont précisés dans la charte éditoriale.
Le glossaire est dit partagé, son contenu étant mis à disposition de tous pour réutilisation.
Le glossaire est construit selon les standards du web sémantique (RDF, SKOS, SPARQL...) permettant ainsi de diffuser des informations structurées et optimisées pour des utilisations plus efficaces.