Le pilotage du SIMM
La Direction de l'eau et de la biodiversité (DEB) du ministère en charge de l'environnement assure la coordination interministérielle du Système d’information sur le milieu marin (SIMM). Elle pilote une instance stratégique (CNP bleu) et une instance consultative (comité permanent des usagers du milieu marin).
L'Office français de la biodiversité (OFB), sous l'autorité du ministère, exerce la coordination technique du SIMM. Il mobilise les acteurs publics du domaine du milieu marin autour d'un comité de coordination technique assisté de plusieurs groupes spécialisés. Les plus actifs sont ceux traitant du référentiel technique (SAR), le service public d'information milieumarinfrance et l'architecture applicative. Ces groupes, partenariaux, peuvent être temporaires comme celui sur la communication (2019-2021) et réactivés au besoin. Les groupes de pilotages s’appuient sur des groupes de travail temporaires pour apporter des solutions sur des sujets précis.
De 2019 à mi-2023, l’OFB a mené ce pilotage technique en partenariat avec l'Ifremer, permettant de poser les premières briques du SIMM.

Fonctionnement des SI métiers
Les systèmes d’information métiers (ou SI métiers), sont cités dans l’arrêté du SNDMM. Chaque SI métier est dédié à une thématique et à un cadre réglementaire lui aussi cité dans le SNDMM. Il dispose également de sa propre gouvernance, définie et décrite dans un document validé par le CNP bleu. Ce document, ou schéma métier, précise quels établissements sont responsables de la production à la diffusion de la donnée. L’organisation choisie doit respecter le cadre commun défini au niveau du SIMM (référentiel, communication…). Les responsables des SI métiers et les instances du SIMM se rendent compte mutuellement des décisions et besoins.

Actuellement au nombre de 24, le nombre de SI métiers peut changer suivant les évolutions du cadre réglementaire et des problématiques environnementales. Le SNDMM fait alors l’objet d’une mise à jour.

Sur la base de ce même fonctionnement, la DEB et l’OFB pilotent le Système d’Information sur l’Eau et les milieux aquatiques (SIE) et le Système d’information sur la Biodiversité (SIB). Ces trois Systèmes d’information environnementaux sont appelés Systèmes d’Information Fédérateurs (SIF). Certains SI métiers sont communs à deux ou trois des SIF : les pilotes des instances sont représentés dans les instances des autres SIF. Les gouvernances sont ainsi concertées et cohérentes.